Na mјestu gdјe se danas nalazi Crkva Rođenja Svetog Jovana Кrstitelja u Jasenovcu pravoslavni Srbi su još 1775. sagradili monumentalni hram. Taj hram je razoren na početku Drugog svetskog rata 1941. godine, kada je stradao i parohijski dom.

Nova crkva je podignuta je 1984. godine na temeljima starog hrama. Tokom posljednjeg rata crkva je najprije oštećena 1991. godine da bi 1995. bila oskrnavljena. Obnovljena je 2000. godine, kada je episkop slavonski Sava kompleks parohijske crkve proglasio manastirom i rezidencijom episkopa slavonskog.